港口物流管理着重在企业内部作业与组织的整合，对顾客相对应的是以服务品质为主要管理重心。因此，评测管理绩效的标准多半为货物运到期、完好率等。然而，在供应链管理模式发展下，实施客户关系管理意味着一种“以客户为中心”的新型管理模式。它是指企业在与客户的接触过程中，通过收集并分析客户与企业联系的所有信息和资料，帮助企业建立和维护一系列与客户之间卓有成效的“一对一关系”，从而使企业提供更快捷和周到的服务，不断提高客户的满意度，吸引和保持更多的客户，实现企业与客户双方价值的最大化。港口物流的客户关系管理的主要组成部分有：
①客户信息的管理。通过主动搜集客户反馈的、表达的或潜在的信息，来改进服务，提高装卸作业质量，提高竞争力，扩大市场份额。
②市场的管理。客户关系管理系统可以帮助海运公司对收集到的大量数据进行统计分析，从而对货源市场和客户需求进行预测，并对货源市场和客户需求进行细分和目标定位，实现“一对一”的货源市场个性化开发和服务，为企业开发新的货源市场，创新服务手段提供依据。另外，通过市场的管理，可以为业务人员提供货源和市场竞争的信息，从而使业务人员在开发资源上做到“有的放矢”，不断提高货源开发的能力。
③客户财产的管理。客户关系管理的主体是客户，海运公司主要是为客户的财产(货物)进行装卸、存储、运输、防护等一系列连贯的、一条龙的服务。
④客户服务的管理。市场激烈竞争的结果使得客户的需求起点越来越高，从而推动企业不断加强管理，改进和创新服务手段。借助通信网和计算机网的多功能集成，构建成完整的综合服务系统，能方便有效地为客户提供多种服务。在客户关系管理的框架下，企业逐渐转而强调跨企业界限的整合，使得顾客关系的维持与管理变得越来越重要，即海运物流管理已从物的处理提升到物的加值方案的管理，亦即须充分了解顾客需求，为其量身定做其所需的产品(服务)。如顾客需要的分装、包装、拌合、粉碎、搬运、储存等半成品加工及保管服务等，在加值服务的同时，业为顾客赢得了更多的商机。
科技的突飞猛进及新型商业模式不断发展，企业固守既有经验寻求突破的经营模式反而成为企业发展的障碍。例如，国际网络兴起后所形成的网络购物通道，可能对传统业者带来极大的冲击。因此，成功的港口企业唯有建立新策略以及培养持续变迁管理的能力，方能在新世纪中继续生存。
在评量港口绩效时，传统评价方法容易片面追求一些绝对数值，如货运量或货运市场占有率等。在现代海运物流中，价值取向将着重于相对加值的创造，港口通过加值服务的提供，为顾客创造增值的同时，有部分回馈给企业，达到双赢之目的。
现代物流强调物流服务功能的恰当定位与完善化、优质化。如今的国际运输业经营人正在向综合物流服务的提供者转化，它们的服务范围从原来的多式联运门到门向货架到货架转化，服务内容从原来的单纯运输服务转变为除提供运输服务外，还提供诸如包装、储存、配送等增值服务，这就对处于综合运输系统中心地位的现代海运功能转变提出了新的要求，其港口的功能特别在现代物流服务方面，从横向向纵向方面发展，其中最明显的就是物流和信息功能的加强，如采购及订单处理、配送、物流咨询、货款回收与结算等，并要求市场定位准确，辐射半径有效。
港口综合物流经营管理的趋势是专注核心业务，并将非核心业务或功能委托给其他专业公司管理。即结合几家专业公司(如专业物流公司、专业信息公司)，形成一虚拟企业体系并整合其功能、实现优势互补的策略联盟，从而使主体企业能提供更好的产品(服务)。
在形成策略联盟的供应链管理架构下，供应链内的相关企业必须将供应链整合所需的信息与其他企业分享，供应链中多数企业可进入数据库中取用作业决策所需的信息，使得策略联盟行为更加有效。
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